熒光顯微鏡用于研究化學物質在細胞中的吸收、運輸、分布和定位。被測物體產(chǎn)生熒光的方式有兩種:自發(fā)熒光，紫外線照射后直接發(fā)出熒光稱為二次熒光，被觀察物經(jīng)熒光染料處理后，經(jīng)紫外光照射后才能發(fā)出熒光。細胞中的一些物質，如葉綠素，受到紫外線照射后會產(chǎn)生自發(fā)熒光。其他物質雖然本身沒有熒光，但用熒光染料或熒光抗體染色后，可以發(fā)出二次熒光。

熒光顯微鏡采用發(fā)光效率高的點光源，發(fā)射一定波長的光(紫外光365nm或紫藍光420nm)作為激發(fā)光，激發(fā)標本中的熒光物質發(fā)出各種顏色的熒光，然后通過物鏡和目鏡的放大進行觀察。在這樣強的對比背景下，即使熒光微弱，也容易識別，靈敏度高，主要用于研究細胞結構功能和化學成分。

熒光顯微鏡可分為兩種類型:透射顯微鏡和下落顯微鏡。前者是原始的，后者是的。兩種熒光顯微鏡的基本構造相似，主要區(qū)別如下:透射激發(fā)光通過標本，整個標本產(chǎn)生熒光，然后進入物鏡，放大倍數(shù)越高，熒光越弱；入射的激發(fā)光投射到樣品表面，樣品表面產(chǎn)生熒光，然后熒光進入物鏡。放大倍數(shù)越高，熒光越強，適合高倍觀察。

熒光顯微鏡的主要部件有汞燈光源、激發(fā)濾板、分色鏡(脫落式)、壓制濾板、暗場聚光器(透射式)等。此外，由于汞燈發(fā)熱嚴重，大部分都裝有吸熱過濾器。有些熒光顯微鏡也有相位差物鏡和環(huán)形光闌，所以可以進行相位差觀察。而熒光顯微鏡采用倒置框架，還有倒置顯微鏡等等。

此外，上述所有顯微鏡都可以通過安裝CCD組裝成數(shù)字顯微鏡，將顯微鏡看到的物理圖像轉換成數(shù)模圖像，并使其在計算機上成像。因此，我們可以從傳統(tǒng)的普通雙目觀察到顯示器上的再現(xiàn)來研究微觀領域，從而提高工作效率。

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